Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCE3A1L190 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE3A1L190 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms