Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC26A0AVF1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC26A0AVF1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC26A0AVF1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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