Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1B0GTW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GTW7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms