Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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