Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2C4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2C4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A0B4J2C4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A0B4J2C4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms