Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPMQ9NSP4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CENPMQ9NSP4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CENPMQ9NSP4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CENPMQ9NSP4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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