Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FOXQ1Q9C009 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FOXQ1Q9C009 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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FOXQ1Q9C009 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FOXQ1Q9C009 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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