Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SMIM3Q9BZL3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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