Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM54Q9BYV2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM54Q9BYV2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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