Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC2P3Q9BVR0 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms