Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.4 ms