Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF34Q969K3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF34Q969K3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms