Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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