Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI7

TMC2, Transmembrane channel-like protein 2, humanhuman

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Length 906 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC2Q8TDI7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMC2Q8TDI7 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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