Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHA9Q7RTU4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms