Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TBCCD1-205ENST00000446782 2186 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 POLR3F-201ENST00000377603 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C16orf54Q6UWD8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.3 ms