Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC4Q5GLZ8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms