Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL162727.1-201ENST00000437712 3043 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BTD-201ENST00000303498 2075 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 M1AP-202ENST00000409585 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CRYZ-205ENST00000417775 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms