Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDRF1Q3B7T1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms