Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSPP1Q1MSJ5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSPP1Q1MSJ5 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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