Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD2Q16342 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms