Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CNGA3Q16281 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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CNGA3Q16281 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CNGA3Q16281 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CNGA3Q16281 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CNGA3Q16281 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CNGA3Q16281 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNGA3Q16281 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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