Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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