Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CDSNQ15517 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms