Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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