Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SHPRHQ149N8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms