Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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TUBA3CQ13748 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TUBA3CQ13748 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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