Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 FGF1-206ENST00000407758 759 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.62-201ENST00000619972 268 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 C10orf82-201ENST00000369210 994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LINC02262-201ENST00000416680 735 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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