Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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