Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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