Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SMARCB1Q12824 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SMARCB1Q12824 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SMARCB1Q12824 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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