Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms