Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
E2F1Q01094 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms