Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN10P78369 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms