Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NCS1P62166 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NCS1P62166 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NCS1P62166 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NCS1P62166 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms