Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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KCNQ1P51787 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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KCNQ1P51787 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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KCNQ1P51787 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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KCNQ1P51787 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNQ1P51787 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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