Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ME1P48163 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms