Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms