Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5OP48047 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms