Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UTRNP46939 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTRNP46939 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTRNP46939 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTRNP46939 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTRNP46939 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTRNP46939 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTRNP46939 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTRNP46939 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UTRNP46939 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UTRNP46939 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms