Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP5P45974 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP5P45974 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP5P45974 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP5P45974 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP5P45974 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP5P45974 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP5P45974 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP5P45974 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms