Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CASP2P42575 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP2P42575 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP2P42575 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms