Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms