Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABCD1P33897 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.4 ms