Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFNP31947 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFNP31947 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFNP31947 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFNP31947 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFNP31947 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFNP31947 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFNP31947 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFNP31947 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFNP31947 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFNP31947 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFNP31947 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms