Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GCAP28676 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCAP28676 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCAP28676 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms