Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT1P26358 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT1P26358 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms