Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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