Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRDP23468 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRDP23468 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms