Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPS6KB1P23443 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms